標本要求:組織、細胞、血液、其它
實(shí)驗周期:3周~4周
收費價(jià)格:每個(gè)樣品每個(gè)基因800元,每個(gè)基因1對引物費70元
產(chǎn)品介紹:亞硫酸氫鹽處理后測序(bisulfite sequencing PCR,BSP)法是檢測基因甲基化的經(jīng)典方法,其原理為:用亞硫酸氨鈉修飾處理基因組DNA,所有未發(fā)生甲基化的胞嘧啶(C)被轉化為尿嘧啶(U)而甲基化的胞嘧啶則不變。隨后設計BSP引物進(jìn)行PCR,在擴增過(guò)程中尿密啶全部陣專(zhuān)化為胸腺嘧啶,最后,將PCR產(chǎn)物克隆至載體后進(jìn)行測序,并且與未經(jīng)處理的序列比較,判斷是否CpG位點(diǎn)發(fā)生甲基化,這種方法稱(chēng)為BSP-克隆測序法。此方法是精確度很高,能明確目的片段中每一個(gè)CpG位點(diǎn)的甲基化狀態(tài)。一般會(huì )選取10個(gè)克隆子測序。
實(shí)驗流程
(1) 樣本接收:組織、細胞、血液、其它
(2) 實(shí)驗步驟: DNA提取-亞硫酸氫鹽處理-純化DNA-PCR擴增-TA克隆-測序
(3) 實(shí)驗結果:完整項目報告(材料、試劑、儀器、方法、數據分析、實(shí)驗結果)
注意事項:
1、組織樣品:新鮮組織放入液氮或-80度保存,組織不少于100mg,低溫運輸
2、培養細胞:通過(guò)細胞計數取不少于2×106個(gè)細胞于EP管,收集細胞沉淀后,液氮速凍,低溫保存或運輸(-80℃,避免反復凍融);
3、血液標本:以抗凝管保存血樣(4℃保存3~5天,如果要長(cháng)時(shí)間保存需放在-80℃);
4、DNA樣品:純度OD260/280比值為1.8-2.0,濃度≥50ng/ul,體積≥50ul。
5、樣本運輸:可選擇以下任何一種方式寄送標本
a組織樣本、細胞樣本以干冰運輸;
b.細胞樣本也可直接寄送培養瓶(密封保證不污染、培養液不漏出);
6、提供詳細的基因信息, BSP方法要求待測序列在350bp左右。我們會(huì )根據客戶(hù)的基因序列信息設計引物,并在方案實(shí)驗過(guò)程中隨時(shí)與客戶(hù)溝通。
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